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K-means聚类的Python实现

生物信息学原理作业第五弹:K-means聚类的实现。 转载请保留出处! K-means聚类的Python实现 原理参考:K-means聚类(上) 数据是老师给的,二维,2 * 3800的数据。 ...

Thu Dec 07 04:21:00 CST 2017 9 6001
DNA序列局部比对(Smith–Waterman algorithm)

生物信息原理作业第三弹:DNA序列局部比对,利用Smith–Waterman算法,python3.6代码实现。 实例以及原理均来自https://en.wikipedia.org/wiki/Smit ...

Fri Dec 01 02:15:00 CST 2017 2 3366
从细菌GFF文件提取CDS序列并转换为氨基酸序列

最近在上生物信息学原理,打算记录一些课上的作业。第一次作业:如题。 基本思路:       1.从GFF中读取CDS的起始终止位置以及正负链信息。GFF格式见 http://blog.sina.c ...

Mon Nov 27 06:34:00 CST 2017 1 2429
DNA序列组装(贪婪算法)

生物信息学原理作业第四弹:DNA序列组装(贪婪算法) 原理:生物信息学(孙啸) 大致思想:       1. 找到权值最大的边;       2. 除去以最大权值边的起始顶点为起始顶点的边; ...

Tue Dec 05 05:33:00 CST 2017 4 1428

 
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